Via het online kenniscentrum is het mogelijk om online te zoeken in de collectie. Een groot gedeelte van de collectie van Museum Maluku is namelijk gedigitaliseerd. De deelcollecties met audiovisueel materiaal, de fotocollectie, publicaties (zoals tijdschriften en boeken) en de databank met historische data zijn hierdoor voor een groot deel online te raadplegen via de online kennisbank. Blader zelf door de online collectie en ontdek! 

In de bibliotheek van Museum Sophiahof, de locatie waar Museum Maluku is gevestigd, is een groot deel van de deelcollectie publicaties te vinden. Deze deelcollectie bevat tijdschriften en boeken.