Yayasan Museum Sejarah Maluku memperlajari, memfasilitasi, dan menyalurkan sejarah, kesenian, kebudayaan, dan perkembangan Moluccans (Kisah orang-orang Maluku) kepada khalayak umum di dalam maupun luar Belanda.

Yayasan Museum Sejarah Maluku membina institusi yang bergerak dibidang budaya dan sejarah kontemporer dengan merawat koleksi, memfasilitasi aktivitas dan proyek, serta terus mengembangkan kerjasama dengan berbagai organisasi.